慢性盆腔炎：慢性盆腔炎患者疼痛不仅限于月经期，平时亦有隐痛，且可能出现反复炎症发作史，对抗炎治疗有效，但内膜异位症抗炎治疗则无效。还需注意凡诊断为慢性盆腔炎经久治疗症状不消者，应考虑有内膜异位症之可能。

子宫肌瘤：子宫有不同程度增大，尤其是壁间子宫肌瘤与子宫肌腺瘤光凭妇科检查不易区分。但子宫肌瘤无痛经史及周期性下腹痛史。

盆腔恶性肿瘤：卵巢恶性肿瘤除在子宫旁扪及固定实性包块外，也可能在盆腔内触及散在转移结节，因而易于子宫内膜异位症相混;直肠内膜异位除便血外，尚可触及硬块而易误诊为直肠癌。但肿瘤患者一般体质差，病情发展迅速，疼痛为持续性，与月经周期无关。凡诊断不明确者，尤其疑有恶变者，应尽早剖腹探查明确诊断。

防治经血逆流：：有些先天性或后天性的引起经血引流不畅的疾病，如处女膜闭锁、阴道闭锁、宫颈狭窄、子宫畸形(特别是残角子宫)、子宫极度后屈等，均可引起经血引流不畅或潴留，致使经血逆流入盆腔，种植、发展为子宫内膜异位症。因此对这些疾病应及早检查、治疗。有生殖器官先天性发育异常者，应在初潮年龄时进行手术治疗后月经期应避免不必要的阴道检查和性生活。

避免手术操作引起的内膜种植：

①剖宫手术时注意保护好伤口，避免将子宫内膜带至切口内种植。

②人工流产时，避免突然降低负压，以防将子宫内膜推入盆腔。

③输卵管通气、通水，子宫输卵管造影要在月经净后3～7天进行。